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@sokosoko_seeyaPh:D Microbial rhodopsin | Structural biology
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I appreciate the devoted support of our international team from the bottom of my heart!! @emeKato celebrated us with this cool mug and this tasty cake today. Thank you!!
Our paper is finally out in Cell! cell.com/cell/fulltext/… During the revision, we solved one more structure (H225F or KALI), performed more electrophysiological, computational, spectroscopic, and biochemical experiments, and conducted optogenetics experiments using KALI. (1/n)
bioRxivで『ロドプシンに結合する色素』の続編プレプリントを公開しました！ 予想外の結果でハラハラ、ドキドキする内容になってるはずです！！！何が起こるか分からない世界だ！！！
Carotenoid pigments enhance rhodopsin-mediated phototrophy by light-harvesting and photocycle-accelerating biorxiv.org/cgi/content/sh… #biorxiv_micrbio
Proton selective conductance and gating of lysosomal cation channel TMEM175 biorxiv.org/cgi/content/sh… #biorxiv_biophys
Our new paper has been published @ISMEJournal !! シアノバクテリアは光合成システムの多様化によって様々な光環境に適応してきたと考えられていましたが、ロドプシンも超重要！ということを明らかにしました🦠☀️ academic.oup.com/ismej/article/… #rhodopsin #cyanobacteria
Our new paper, with Dr. Takaramoto as the first author and in collaboration with Prof. Béjà's lab, has been published in J. Mol. Biol.!🥳🎉We investigated a new cation channel rhodopsin, HulaCCR, discovered from Lake Hula✨ sciencedirect.com/science/articl… @JMolBiol #OpenAccess
BioJapan 2024、名古屋工業大の神取特別教授がロドプシンの研究でバイオインダストリー大賞を受賞 bio.nikkeibp.co.jp/atcl/news/p1/2…
De novo design of ATPase based on the blueprint optimized for harboring the P-loop motif biorxiv.org/cgi/content/sh… #biorxiv_biophys
Phenix and ORCA quantum refinement @IUCrJ doi.org/10.1107/S20522… @lunduniversity #LUNARC @Vetenskapsradet #SREss3 #crystallography #neutron #cryoEM #quantum #refinement #QMMM #nitrogenase #superoxidedismutase #particulate #methane #monooxygenase @IUCr #openaccess
Solid-state NMR study on the structural changes of halorhodopsin upon Cl- binding sciencedirect.com/science/articl…
ここまで駆け抜けることができたのは、英明先生や福田先生をはじめとする研究室や共同研究先の皆さんの多大なるご協力のお陰です 自分が加藤研究室初の博士号取得者となるのは非常に畏れ多いですが、これからも加藤研出身者として名に恥じぬよう精進して行きたいと思います！
実は但馬くんは3年前の秋に博士課程からうちに来てくれたので初めての学生と言うわけではないのですが、紛うことなきうちのラボ初の博士号取得者です！ （但馬くんの論文はこちら：sciencedirect.com/science/articl………） 本当に、駆け抜けるような3年間でしたね。 但馬くん、あらためておめでとう！
De novo design of high-affinity protein binders with AlphaProteo @GoogleDeepMind 1/ AlphaProteo is a new machine learning system for designing high-affinity protein binders. It achieves 3-300x better binding affinities and success rates compared to existing methods. 2/…
CryoEM structure of the channelrhodopsin GtCCR4 from Guillardia theta (PDB code: 8YEL) #sciart #molecularart #scivis @proteinimaging @dzine_ai behance.net/gallery/207138…
Technical Report of HelixFold3 for Biomolecular Structure Prediction The PaddleHelix research team at Baidu have released their AlphaFold3 replication under an open-source noncommercial license. Performance approaches that of AlphaFold3. abs: arxiv.org/abs/2408.16975 website:…
大昔に、大学院の授業の課題で選んだやつだ。当時、BRってサイズ小さいし、単体で機能するし、確かに人工細胞に向いてる！！！って感動した記憶。今でも好きな論文の一つです。 非生命から生命を作れるか？ – 光からATPを生産してタンパク質を作る「人工細胞」の挑戦 academist-cf.com/journal/?p=110…
「試験にでる(た)人工細胞」、元ネタになったのはJAMSTEC車さん@liposomania の論文 nature.com/articles/s4146… ですね
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